View Artikel Ilmiah
Kembali| NIM (Student Number) | B1J007046 |
|---|---|
| Nama Mahasiswa | MAYARESTY SETIANING |
| Judul Artikel | KEANEKARAGAMAN GENETIK KECIPIR (Psophocarpus tetragonolobus (L.) DC.) POLONG PENDEK TIPE LIAR DAN MUTAN (EMS) BERDASARKAN MARKA RAPD |
| Abstrak | Tanaman kecipir (Psophocarpus tetragonolobus (L.) DC.) dikategorikan sebagai tanaman yang bernutrisi tinggi. Tujuan penelitian ini adalah untuk 1) mengetahui perbedaan hasil marka pada kecipir polong pendek tipe liar dan kecipir polong pendek mutan keturunan kedua, 2) untuk mengetahui keanekaragaman genetik antar populasi tersebut. Penelitian ini dilakukan menggunakan metode PCR-RAPD dengan 5 primer terpilih yaitu OPH 15, OPZ 10, OPK 20, UBC 30, dan UBC 171. Isolasi DNA dari kotiledon dan akar kecipir menggunakan metode CTAB dengan hasil konsentrasi antara 18 – 399,5 µg/ml. PCR dibuat dengan volume 20 µl yang mengandung 20 ng DNA template, primer DNA 20 pmol, 10 µl GoTaq Green PCR mastermix 2X (buffer (pH 8,5), 400 µM dNTP, 3mM MgCl2, Taq polimerase, loading dye). Hasil RAPD dielektroforesis menggunakan 1,5% gel agarose yang ditambah 0,2 µl etidium bromida. Gel divisualisasi dan difoto dibawah sinar UV menghasilkan 57 pita polimorfik sehingga kelima primer tersebut menunjukan polimorfisme. Ukuran fragmen marka RAPD dari kelima primer mulai dari 144 bp sampai dengan 6.672 bp. Berdasarkan AMOVA menggunakan data biner, nilai keanekaragaman molekuler pada mutan yaitu sebesar 1,0000 +/- 0,1265 dan 0,223529 +/- 0,146996 dan pada tipe liar adalah 1,0000 +/- 0,1265 dan 0,376471 +/- 0,239800. Hal ini mengindikasikan bahwa nilai keanekaragaman genetiknya tinggi. |
| Abstrak (Inggris) | Winged bean (Psophocarpus tetragonolobus (L.) DC.) is categorized as high nutrition plant. This study was purposed to determine 1) different markers of short pod of wild type and short pod of second generation of mutant using an RAPD technique, 2) genetic variability between these two populations. Along this study a PCR-RAPD technique was used. This technique applied 5 different primers i.e : OPH 15, OPZ 10, OPK 20, UBC 30, and UBC 171. The plant DNA was isolated from cotiledon and young roots of the winged bean seed using a CTAB method, resulted in different amount varied from 18 to 399,5 µg/ml. A PCR technique was done using 20 µl containing 20 ng template DNA, 20 pmol DNA primer, 10 µl GoTaq Green PCR mastermix 2X (buffer (pH 8.5), 400 μM dNTP, 3 mM MgCl2, Taq polymerase, loading dye). RAPD results was then electrophoresed using 1.5% agarose gel plus 0.2 µl ethidium bromide. Gel was visualized and photographed under UV light, that of producing 57 polymorphic bands, so that the all primers used were showing polymorphism. The size of RAPD marker fragments all primers ranging from 144 bp to 6672 bp. Based on AMOVA of the binary data, the value of molecular diversity indices of the mutant are 1.0000 + / - 0.1265 and 0.223529 + / - 0.146996 and the wild type are 1.0000 + / - 0.1265 and 0.376471 + / - 0.239800. This is indicated that the diversity value are high. |
| Kata Kunci | Keanekagaraman genetik, kecipir, RAPD |
| Nama Pembimbing 1 | Dr.Sc.Agr. Nurtjahjo Dwi Sasongko, M.App.Sc |
| Nama Pembimbing 2 | Dr.Tech.Sc., Ir. Budi Prakoso, M.Sc |
| Tahun | 2013 |
| Jumlah Halaman | 10 |
Page generated in 0.0728 seconds.